La fatturazione elettronica business-to-business (B2B) in Svizzera è su base volontaria, anche se il governo svizzero ne promuove fortemente l'adozione per i vantaggi in termini di efficienza e per l'allineamento con iniziative europee come il ViDA (IVA nell'era digitale). I formati consigliati sono swissDIGIN, UBL XML, CII, ZUGFeRD/Factur‑X e Peppol BIS. Le aziende che adottano la fatturazione elettronica devono assicurare l'integrità, l'autenticità e l'inalterabilità delle fatture mediante firme elettroniche ai sensi della normativa svizzera ZertES. Come per le transazioni B2G, anche le fatture elettroniche B2B devono essere conservate per 10 anni.